Die Sammlungen des Museums im Herzen der Altstadt geben Einblicke in die reiche Vor- und Frühgeschichte des Bodenseeraumes. Ein Schwerpunkt ist weiter das Mittelalter, wo im 15. Jh. mit dem Konzil ein Ereignis von weltweiter Bedeutung in Konstanz stattfand. Häufig gibt es interessante Sonderaustellungen, so 2008 über Napoleon III, der seine Jugend in dieser Region verbrachte.
Untergebracht ist das Museum im ehemaligen Zunfthaus der Metzger und vermittelt in wunderschönem Ambiente Innenansichten der Konstanzer Altstadt.